Mäkké kapsuly môžu byť plnené rôznymi olejmi alebo tekutými liečivami alebo suspenziami, ktoré nerozpúšťajú želatínu, alebo môžu byť plnené pevnými liečivami. Obsah kvapaliny možno rozdeliť do troch kategórií:
(1) Prchavé alebo neprchavé-kvapaliny nemiešateľné s vodou, ako sú rastlinné oleje alebo aromatické oleje.
(2) Neprchavé kvapaliny miešateľné s vodou, ako je polyetylénglykol a neiónové povrchovo aktívne látky.
(3) Zlúčeniny miešateľné s vodou, ale s nízkou prchavosťou, ako je glycerol, propylénglykol a izopropanol.
Lieky často absorbujú vodu, ktorá môže zmeniť obsah vlhkosti v obale mäkkej kapsuly. Ak je liečivo hydrofilné, malo by zadržiavať 5 % vody. Oleje sa vo všeobecnosti používajú ako rozpúšťadlá alebo suspenzné médiá pre lieky. Hoci mäkké kapsuly-naplnené olejom neobsahujú vodu, vlhkosť alebo voda z obalu môže preniknúť cez stenu kapsuly. Ak je liečivo hydrofilné, malo by zadržiavať 3 % vody. Ak tekutý liek obsahuje viac ako 50 % vody alebo obsahuje prchavé rozpúšťadlá s nízkou molekulovou hmotnosťou, ktoré sú miešateľné s vodou, ako je etanol, acetón, amíny, kyseliny a estery, môže mäkké kapsuly zmäknúť alebo rozpustiť. Preto nie je vhodné vyrábať mäkké kapsuly. Pri plnení tekutých liekov by malo byť pH kontrolované medzi 2,5 a 7,5. V opačnom prípade môžu mäkké kapsuly počas skladovania vytiecť v dôsledku kyslej hydrolýzy želatíny. Silná zásaditosť môže denaturovať želatínu a ovplyvniť rozpustnosť mäkkých kapsúl. Obsah železa v surovine želatíny mäkkých kapsúl by nemal presiahnuť 0,0015 %, aby sa predišlo znehodnoteniu liekov citlivých na železo{16}.